Сотрудники Центрального университета разработали новый метод вычислений для выявления генов, которые клетки колоректального рака используют для своего роста. Информация об этом была предоставлена пресс-службой университета.
По данным Всемирной организации здравоохранения, в мире каждый год фиксируется свыше 1,9 миллиона новых случаев рака толстой и прямой кишки. Умереть от этого заболевания ежегодно удаётся более 900 тысячам людей, что делает его вторым по частоте источником онкологической смертности.
Основной проблемой является резистентность опухолей к лечению. У многих пациентов наблюдается отсутствие реакции на известные препараты. Разработанный алгоритм анализирует три вида данных одновременно: физические взаимодействия между длинной некодирующей РНК SNHG1 и ДНК, метки активности генов и расположение суперэнхансеров, которые являются сильными активаторами генов. Этот метод помогает выделить области, где SNHG1 вероятнее всего воздействует на регуляцию генов в раковых клетках.
Информация в статье носит справочный характер и не заменяет консультацию врача. Перед применением рекомендаций обратитесь к специалисту.
Применив алгоритм к данным о колоректальном раке, исследователи составили список из 12 перспективных генов-мишеней. Уровень SNHG1 в опухолевых тканях оказался более чем в три раза выше, чем в здоровых. Среди выявленных генов есть мишени для уже существующих препаратов, например, ген TOP1, белок которого является мишенью для иринотекана, одного из основных химиотерапевтических средств при колоректальном раке. Это подтверждает точность нового подхода.
Ранее биологам приходилось долго и методом проб и ошибок определять, какие гены могут активироваться различными длинными некодирующими РНК через суперэнхансеры. Мы предложили метод, который за несколько часов вычислений предоставляет проверяемую гипотезу — краткий список приоритетных генов-мишеней. Это подобно навигатору в геномном лабиринте: исследователи и онкологи сразу видят возможные направления для терапии. Важно, что метод может быть применён не только к колоректальному, но и к другим видам опухолей.
Фото: hi-tech.mail.ru
Медицинский эксперт
Это объединение практикующих врачей и специалистов в области медицины, принимающих участие в подготовке, проверке и редактуре медицинских материалов на сайте.В состав медицинской коллегии входят врачи различных специальностей: терапевты, инфекционисты, эпидемиологи, гастроэнтерологи, офтальмологи, аллергологи-иммунологи, психотерапевты, стоматологи, а также специалисты в области репродуктивной медицины, скорой помощи и медицинской журналистики.
Материалы проходят проверку с учетом современных клинических рекомендаций, научных данных и практического опыта врачей. Основная задача Медколлегии — обеспечить достоверность, актуальность и понятность медицинской информации для пользователей.