Острый миелоидный лейкоз — рак крови, возникающий в костном мозге, по-прежнему представляет трудности для врачей: нет надежных методов, позволяющих заранее определить, как пациенты отреагируют на химиотерапию. Многие больные сталкиваются с рефрактерным течением, при котором полная ремиссия не наступает даже при лечении.
Специалисты Королевского колледжа Лондона решили исследовать эту проблему с помощью машинного обучения. Они проанализировали данные 271 пациента, получавшего стандартную химиотерапию, и разработали три модели, постепенно добавляя клинические и биологические параметры.
Неожиданно для учёных, эндогенные ретровирусы — остатки древних вирусов, которые инфицировали предков человека миллионы лет назад и интегрировались в его геном, оказались важными для точности прогноза. Эти последовательности находятся в некодирующих участках ДНК, слабо изучены и называются «темным геномом». Исследования показали, что активность ЭРВ связана с плохим ответом на химиотерапию.
Большинство исследований рака сосредоточено на обычных генах. Однако так называемый «темный геном», составляющий значительную часть нашей ДНК, остается без внимания. Мы выявили сигнатуру древних вирусных последовательностей в «темном геноме», которая добавила ценную информацию к традиционным подходам к экспрессии генов для прогнозирования реакции на химиотерапию при остром миелоидном лейкозе.
Фото: hi-tech.mail.ru
Материалы проходят проверку с учетом современных клинических рекомендаций, научных данных и практического опыта врачей. Основная задача Медколлегии — обеспечить достоверность, актуальность и понятность медицинской информации для пользователей.